在国务院督查组来临之前，浙江已经掀起针对新开工项目的“清理风暴”，全省198个新开工项目因“存在问题”而被要求“暂停建设、限期整改”，沿海大通道“甬台温铁路”赫然在列。浙江省要求各地发改、经贸、国土、环保、安监、银监等部门，要根据各自职能，认真分析“问题项目”原因，提出整改措施。
浙江省发改委等六部门日前联合发出的《关于对存在问题的新开工项目依法依规进行处理的通知》指出，经清理，上半年浙江省列入统计范围的总投资1亿元及以上的新开工项目(其中钢铁等重点行业投资3000万元及以上)共869个，计划总投资#亿元，已完成投资#亿元。对照清理范围，全省有109个项目因统计问题不应列入此次清理范围；根据清理标准，全省有562个项目符合国家产业政策、项目审核程序、土地审批、环评审批、信贷政策执行规定以及安全生产等规定。但有198个项目存在一些问题，占列入统计范围清理项目总数的#%。在存在问题的新开工项目中，有8个项目不符合项目审核程序规定，主要存在项目未经审核就开工建设问题；有157个项目不符合土地审批规定，其中未办理农转用手续但已办理用地预审手续的项目有54个，未办理任何用地手续的项目有103个；有48个项目不符合环评审批规定；有6个项目不符合贷款政策执行规定，主要存在项目未通过用地和环评审批等程序就发放贷款以及将流动资金贷款用于固定资产投资等问题。
据悉，在六部门审核发布的“存在问题的新开工项目”名单中发现，有“浙江沿海大通道”之称的甬台温铁路，体现在甬台温铁路乐清段工程建设指挥部、台州市黄岩区甬台温铁路建设指挥部、甬台温铁路三门段工程建设指挥部等，共涉及3个市近10个县市区，存在的主要问题是各路段建设指挥部尚未为负责的路段办理任何用地手续。有资料显示，
